Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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NFIXQ14938 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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NFIXQ14938 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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