Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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