Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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UBE4AQ14139 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE4AQ14139 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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