Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL4A6Q14031 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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COL4A6Q14031 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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COL4A6Q14031 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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COL4A6Q14031 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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