Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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