Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCINQ13939 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CCINQ13939 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CCINQ13939 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CCINQ13939 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CCINQ13939 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CCINQ13939 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCINQ13939 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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