Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms