Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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