Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRQ13535 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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