Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPP1R1AQ13522 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms