Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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