Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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