Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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