Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms