Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2BQ13224 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
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