Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM32Q13049 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms