Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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