Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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