Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms