Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms