Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms