Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1T1Q06455 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms