Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms