Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms