Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms