Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms