Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms