Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB1P82279 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB1P82279 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms