Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNRPNP63162 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms