Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms