Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS3AP61247 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms