Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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CLDN12P56749 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLDN12P56749 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLDN12P56749 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN12P56749 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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