Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms