Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms