Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms