Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP153P49790 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP153P49790 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms