Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTAP49354 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms