Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA2P42262 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms