Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms