Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms