Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPC1P35052 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPC1P35052 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPC1P35052 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms