Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms