Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms