Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMBRP28336 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMBRP28336 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMBRP28336 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMBRP28336 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMBRP28336 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMBRP28336 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMBRP28336 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMBRP28336 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMBRP28336 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms