Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms