Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PTPRGP23470 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
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PTPRGP23470 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRGP23470 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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