Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms