Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPI1P17947 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms