Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms