Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms